蔡元培任职北大校长的最后一个学期，是在极其艰难而困苦的条件下度过的。整个的8月，他与京城的七所国立中学的校长，几乎什么都没干，就做了一件事：——找政府要钱。
这个时候的他，如果有人问他，对于一个校长，最需要的是什么，他会毫不犹疑的回答是钱。所谓，一文钱难倒英雄汉，有啥别有病，没啥别没钱。
这个时候，常挂在他嘴上的话是，“解决经费困难，实一最大而最重要之事。”
是呀，开学在即，到处都需要钱，但学校却“不明一文，教育费积欠在5个月以上”。
这时候，北京的傀儡总统已经换上了黎元洪，前面已经说了，他面临是怎样的财政状况。在某种意义上可以说，黎元洪第二次下台的直接原因就是穷。
从政府那里要不来钱，学总是要开的。但老师马上要开始新学期讲课了，印讲义的钱都没有。本来就欠着老师们的工资，总不能让他们拿自己的钱印讲义吧！
大事办不了就解决小事吧，能干点啥就干点啥，没有办法，蔡元培和大家商量后，决定和学生收点讲义费，没想到竟闹出一场“北大讲义费的风波”。
有文章这样记载“北大讲义费的风波”：
蔡先生何等温文尔雅的人物，怎么会打人？你这不是造谣吗？
蔡先生要打人，是有记录的，并非捏造。
蒋梦麟先生在《西潮》里面写到：“‘你们这班懦夫！’他蔡元培很气愤地喊道，袖子高高地卷到肘子以上，两只拳头不断在空中摇晃。‘有胆的就请站出来与我决斗。如果你们哪一个敢碰一碰教员，我就揍他！’”
“要不是蒋先生明确写了，实不敢相信这是温文尔雅的蔡先生干出来的事情。
看，蔡先生就是蔡先生，要打架都说“请站出来与我决斗”，多文雅啊。
这是1922年的事情，蔡元培先生已经五十四岁了，干吗要跟学生拼老命呢？竟然是为了收讲义费。
上学收书本费，或者教材费，这天经地义的事情，蔡先生至于如此愤怒吗？
把老实人逼到这份儿上，说起来是北大的学生太过分了。
原来，五四运动之后，挟爱国胜利之余威，北大的学生组织力量十分强大，学生的许多事情学校不能干涉。这本来是学生自治的一大成就，使北大思想越发活跃。然而，物极必反，既然无人管束，学生中毛猴子倾向的家伙也逐渐翘起了尾巴。