就在张天成的信使到京之后，将郑芝龙呈交给大中朝的降书顺表以及部将的名单交到了肖🃂🕀🆢天健的手中，肖天健召集诸臣再一次商定了分封之后，便马上派出使臣，持他的圣旨前往福建宣旨，从郑家手中接管泉州府、汀州府、漳州府等地。
同时按照原来大中朝议和的条件，所有郑军就地接受大中军的整编，包括郑家的水军以及商🄕船船队以及水手们，也都⛣在泉州和漳州等地沿海港口驻泊，等候接受大中朝的整编。
而郑芝龙在接到了肖天健的圣旨之后，得知了他被封为靖海侯这个结果非常满意，事先他也打听过有关大中朝封爵之事，本以为即便是肖天健按照原来的约定，对他封爵，最多也就是能给他封个子爵男爵之类的爵位就算是不错了，但是没成想肖天健居然如此大方，一下便封他了个侯爵，保持了他的爵位不低于永历朝分封他的爵位，这让他非常满意，也觉得很有面子。
包括他的那些弟弟以及族亲，也都各有封赏，这让郑家这些头领们也都放心了下来，起码在这方面，大中朝皇帝是说话算数的，没有对他们过分的刻薄。
至于郑军🜴🆔接受整编，他们也没什么话可说的，陆师肯定是全部要被大中军接收过去，很可能会就地遣散，这一点没什么可🝀🟐担心的。
但是对于郑家水师的♜整编，郑家却是有一点想🏌法的，毕竟这个时代军船和民船之间并没有明显的界线，包括西方的帆船，也一样是既可以运货也可以进行海上交战之用，郑家麾下大大小小拥有各种船只两千多条，其中超出四百料以上的大福船和二号福船以及海沧船、白艚船、乌艚船、广船、快船五六百条，其余的还有小一些的近海用的四百料一下的小型海船还有一千余条。
而水师之中的水手也有近两万人，这🞕🔃些人平时可以操舟行商，战时🔀随时都抄家伙上阵就是水兵，这些船只和水手具体该怎么划分，留给他们郑家多少船只和水手让他们今后继续行商之用，便成了关键的问题。
在这件事上，其实双方之前也是有过商议的，大中朝提出可以给郑家留下二百条四百料以上的海船，作为他们今后行商之用，其余船只则交给大中朝官方进行处置，而那些郑家水卒，则按照他们的意愿决定去🟁🚎留，愿意留在郑家手下继续做事的人，可以留下，愿意加入大中朝海军的，则可以接受整编。
但是现在郑家投顺有点晚，作为惩罚，原来的大中朝提出的条件便不能继续执行了，按照肖天健的指示，在原来的额度上大刀一挥裁去一半，原来二百条船，现在只许郑家保🎧📡留一百条，而人员方面也仅仅允许郑家保留三千人，其余的全部交由大中朝来进行甄选之🔐⛗后另行安置。
郑家对于大中朝提出的新🖲🖠方案颇为不满，但是现如今他们也没有继续反抗的余地，只能听命于大中朝的安排。
另外肖天健招郑芝龙以及郑👤家上下受封之人赴南京面圣，说要☟🀧亲自册封郑芝龙以及🞠郑家上下受封之人，以示恩典。
对此郑家上下颇为担心，有心想要不去，但是这个时候郑军上下军心已散，而且随着朝廷敕令下达之后，石冉和刘耀本各率一万精兵，分头进👡🐣入到了泉州府和漳州府，并且分出一部分兵力接管了汀州府。
在大中军的兵锋之下，郑芝龙有心想要不去南京，但是这个时候却找不到一个合适的理由来拒绝，否则的话摆明了就是抗旨不尊，那么接下来到底会发生🛵♉🆣什么，郑家上下🏸无法预料。
于是无奈之下，郑芝龙只得谢恩领旨，表示会尽快赴南京🈝⚼听封，但是在他们家族内部商议之🄕后，郑芝龙还是让郑芝豹托病为理由，留在泉州坐镇，以防郑家上下赴南京一旦有所变故，他们总算是留下一个后手。
就在郑芝龙受命前往南京的时候，各方对郑军的接管也随即展开，一批批郑军奉命放下了武器，被大中军暂时圈管起来，然后分批进行遣散，为此肖天健着令户部拨发出了二十万龙币作为遣散费用，并且令各地官员对于原属本地的郑军遣散兵员进行编管安置，授之于田，令其回乡耕🁰作。
对于郑家水师方面，大中军采取人船分离的办法，暂时令郑家水师兵将全部登岸，离开他们的船只，由大中朝海军派人接管郑家原有的各式战船，除了准许郑家自行选留下一百条船只之外，其余的船只进行甄选，留下一部分坚固的船只，作为战船补充入海军之中使用，至于剩下的一些不堪作为战船使用的船只，一部分直接拆除，其余可用的船只则准许浙江、福建🜑、南直隶沿海商贾赎买，作为今后通海行商之用。
郑家看准这个机会，又⛬🝟通过出钱赎🇻买的办法，从中买回⚪🔉⚞了一批原属于他们的船只。